MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Citrobacter koseri ATCC BAA-895 chromosome

Total Repeats: 100920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009792	ATT	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009792	CAG	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009792	TCTG	2	8	151	158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009792	CGC	2	6	197	202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009792	CG	3	6	210	215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009792	TGG	2	6	248	253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009792	ACT	2	6	258	263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009792	GTC	2	6	264	269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009792	AAC	2	6	290	295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009792	CAG	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009792	TAA	2	6	307	312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009792	CGG	2	6	349	354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009792	GGC	2	6	482	487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009792	TGCTT	2	10	495	504	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009792	CAC	2	6	505	510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009792	CAA	2	6	565	570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009792	A	7	7	695	701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009792	GAA	2	6	710	715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009792	GAA	3	9	857	865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157144297
20	NC_009792	ACA	2	6	878	883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157144297
21	NC_009792	TAT	3	9	901	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157144297
22	NC_009792	TTG	2	6	914	919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157144297
23	NC_009792	ATTA	2	8	926	933	50 %	50 %	0 %	0 %	157144297
24	NC_009792	TCT	2	6	1029	1034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157144297
25	NC_009792	GCG	2	6	1062	1067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144297
26	NC_009792	GCC	2	6	1142	1147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144297
27	NC_009792	CGCTTT	2	12	1167	1178	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	157144297
28	NC_009792	GGC	2	6	1289	1294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144297
29	NC_009792	GC	3	6	1293	1298	0 %	0 %	50 %	50 %	157144297
30	NC_009792	TCA	2	6	1323	1328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144297
31	NC_009792	TGT	2	6	1372	1377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157144297
32	NC_009792	TCG	2	6	1398	1403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144297
33	NC_009792	TGG	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144297
34	NC_009792	CCA	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157144297
35	NC_009792	A	6	6	1511	1516	100 %	0 %	0 %	0 %	157144297
36	NC_009792	AGC	2	6	1548	1553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144297
37	NC_009792	CGG	2	6	1573	1578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144297
38	NC_009792	TGA	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144297
39	NC_009792	CTG	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144297
40	NC_009792	CAT	2	6	1729	1734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144297
41	NC_009792	CTG	2	6	1925	1930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144297
42	NC_009792	GAT	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144297
43	NC_009792	GCT	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144297
44	NC_009792	A	7	7	2117	2123	100 %	0 %	0 %	0 %	157144297
45	NC_009792	T	6	6	2173	2178	0 %	100 %	0 %	0 %	157144298
46	NC_009792	ATG	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144298
47	NC_009792	ATCA	2	8	2309	2316	50 %	25 %	0 %	25 %	157144298
48	NC_009792	CA	3	6	2367	2372	50 %	0 %	0 %	50 %	157144299
49	NC_009792	ATA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157144299
50	NC_009792	GCA	2	6	2415	2420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144299
51	NC_009792	GCA	2	6	2479	2484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144299
52	NC_009792	GAA	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157144299
53	NC_009792	CTT	2	6	2591	2596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157144299
54	NC_009792	CAT	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144299
55	NC_009792	CTG	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144299
56	NC_009792	ACA	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157144299
57	NC_009792	T	6	6	2776	2781	0 %	100 %	0 %	0 %	157144299
58	NC_009792	GCG	2	6	2823	2828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144299
59	NC_009792	TCCT	2	8	2862	2869	0 %	50 %	0 %	50 %	157144299
60	NC_009792	CTG	2	6	2900	2905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144299
61	NC_009792	TGC	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144299
62	NC_009792	GAA	2	6	2957	2962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157144299
63	NC_009792	CGA	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144299
64	NC_009792	GCT	2	6	2986	2991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144299
65	NC_009792	CCT	2	6	3037	3042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157144299
66	NC_009792	CATT	2	8	3057	3064	25 %	50 %	0 %	25 %	157144299
67	NC_009792	TAC	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144300
68	NC_009792	CAG	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144300
69	NC_009792	ACC	2	6	3180	3185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157144300
70	NC_009792	CCG	2	6	3283	3288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144300
71	NC_009792	GAC	2	6	3386	3391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144300
72	NC_009792	A	6	6	3650	3655	100 %	0 %	0 %	0 %	157144300
73	NC_009792	AGC	2	6	3691	3696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144300
74	NC_009792	A	6	6	3700	3705	100 %	0 %	0 %	0 %	157144300
75	NC_009792	AC	3	6	3739	3744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009792	T	7	7	3768	3774	0 %	100 %	0 %	0 %	157144301
77	NC_009792	TTC	2	6	3793	3798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157144301
78	NC_009792	GCG	2	6	3854	3859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144301
79	NC_009792	GCCC	2	8	3865	3872	0 %	0 %	25 %	75 %	157144301
80	NC_009792	ATC	2	6	3908	3913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144301
81	NC_009792	CCCAGC	2	12	3914	3925	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	157144301
82	NC_009792	CCG	2	6	3975	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144301
83	NC_009792	T	6	6	3991	3996	0 %	100 %	0 %	0 %	157144301
84	NC_009792	GCC	2	6	4013	4018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144301
85	NC_009792	CAGCGC	2	12	4129	4140	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	157144301
86	NC_009792	CCA	2	6	4149	4154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157144301
87	NC_009792	ACG	2	6	4159	4164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144301
88	NC_009792	CAGC	2	8	4183	4190	25 %	0 %	25 %	50 %	157144301
89	NC_009792	CAG	2	6	4195	4200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144301
90	NC_009792	GC	3	6	4212	4217	0 %	0 %	50 %	50 %	157144301
91	NC_009792	CTT	2	6	4251	4256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157144301
92	NC_009792	CAC	2	6	4315	4320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157144301
93	NC_009792	CAG	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144301
94	NC_009792	TTC	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157144301
95	NC_009792	AAC	2	6	4451	4456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157144301
96	NC_009792	GAT	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144301
97	NC_009792	GCC	2	6	4621	4626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144301
98	NC_009792	ACG	2	6	4672	4677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144301
99	NC_009792	TGG	2	6	4695	4700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144301
100	NC_009792	CCG	2	6	4715	4720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144301
101	NC_009792	GAA	2	6	4729	4734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157144301
102	NC_009792	ATC	2	6	4757	4762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144301
103	NC_009792	TAG	2	6	4874	4879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144301
104	NC_009792	ATC	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144301
105	NC_009792	ACC	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157144301
106	NC_009792	AAG	2	6	5123	5128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157144301
107	NC_009792	T	6	6	5155	5160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009792	CG	3	6	5298	5303	0 %	0 %	50 %	50 %	157144302
109	NC_009792	GCA	4	12	5325	5336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144302
110	NC_009792	CGC	2	6	5350	5355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144302
111	NC_009792	CAC	2	6	5365	5370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157144302
112	NC_009792	GCC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144302
113	NC_009792	CGC	2	6	5476	5481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144302
114	NC_009792	GCC	2	6	5504	5509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144302
115	NC_009792	A	6	6	5539	5544	100 %	0 %	0 %	0 %	157144302
116	NC_009792	GGT	2	6	5548	5553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144302
117	NC_009792	GAA	2	6	5554	5559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157144302
118	NC_009792	CGC	2	6	5563	5568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144302
119	NC_009792	AG	3	6	5614	5619	50 %	0 %	50 %	0 %	157144302
120	NC_009792	CCA	2	6	5694	5699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157144302
121	NC_009792	GC	3	6	5700	5705	0 %	0 %	50 %	50 %	157144302
122	NC_009792	CCG	2	6	5736	5741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144302
123	NC_009792	CGC	2	6	5806	5811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144302
124	NC_009792	GC	3	6	5810	5815	0 %	0 %	50 %	50 %	157144302
125	NC_009792	AGC	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144302
126	NC_009792	GCCCC	2	10	5904	5913	0 %	0 %	20 %	80 %	157144302
127	NC_009792	CTG	3	9	5917	5925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144302
128	NC_009792	TCA	2	6	5939	5944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144302
129	NC_009792	GCC	2	6	5946	5951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144302
130	NC_009792	GCC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144302
131	NC_009792	CGA	2	6	6018	6023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144302
132	NC_009792	ATC	3	9	6044	6052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144302
133	NC_009792	GC	3	6	6056	6061	0 %	0 %	50 %	50 %	157144302
134	NC_009792	GCA	2	6	6080	6085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144302
135	NC_009792	CAC	2	6	6143	6148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157144302
136	NC_009792	GAA	2	6	6217	6222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157144302
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138	NC_009792	CAG	2	6	6400	6405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144302
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267	NC_009792	GCCCG	2	10	11854	11863	0 %	0 %	40 %	60 %	157144309
268	NC_009792	CATA	2	8	11872	11879	50 %	25 %	0 %	25 %	157144309
269	NC_009792	GC	3	6	11941	11946	0 %	0 %	50 %	50 %	157144309
270	NC_009792	CGT	2	6	11982	11987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144309
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278	NC_009792	TAG	2	6	12294	12299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144308
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281	NC_009792	A	6	6	12465	12470	100 %	0 %	0 %	0 %	157144308
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287	NC_009792	GTG	2	6	12736	12741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
288	NC_009792	CAA	2	6	12784	12789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_009792	ACA	2	6	12799	12804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_009792	GGC	2	6	12805	12810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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325	NC_009792	T	7	7	14123	14129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_009792	AAGC	2	8	16300	16307	50 %	0 %	25 %	25 %	157144314
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388	NC_009792	CATC	2	8	16821	16828	25 %	25 %	0 %	50 %	157144315
389	NC_009792	CAT	2	6	16860	16865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144315
390	NC_009792	AATC	2	8	16881	16888	50 %	25 %	0 %	25 %	157144315
391	NC_009792	CGA	2	6	16952	16957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144315
392	NC_009792	ACCA	2	8	16979	16986	50 %	0 %	0 %	50 %	157144315
393	NC_009792	CGA	2	6	17080	17085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144315
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